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Notre site présente des expériences réalisées au laboratoire Inphyni qui permettent de visualiser des micro-organismes se déplaçant dans des montages micro-fluidiques. Les micro-organismes étudiés sont des parasites de plantes. Il est connu que ces micro-organismes modifient leur déplacement en fonction de leur environnement, notamment les concentrations ioniques.
Notre étude
Dans un montage micro-fluidique, le suivi (tracking) des micro-organismes au cours du temps permet de mieux comprendre le lien environnement/déplacement. Notre stage a consisté à utiliser et modifier des programmes (par exemple en utilisant Matlab ou ImageJ) permettant de tracker les trajectoires des micro-organismes puis d’en extraire des informations pertinentes.
