Traitement


La densité de spore par région en fonction du milieu:


Les études sur ces spores ont démontré qu’elles évitaient le potassium, on essaye donc d’étudier la trajectoire de ces zoospores dans des milieux contenant un liquide avec une plus ou moins forte concentration en potassium


Développement:


On a donc effectué nos test avec deux vidéos différentes, une avec une concentration en potassium très basse et pour montre le contraste la deuxième vidéo elle avait une concentration en potassium très élevé.

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(a) video d'une expérience à haute concentration en potassium



(b) video d'une expérience à faible concentration en potassium



Durant notre stage nos expérience se déroulait toujours en 2 partie :

la première partie était de prendre les vidéos qui nous était fournis par notre encadrant et de les analysé grâce à Fiji. En utilisant le plugin TrackMate, nous obtenons un tableau donnant les positions des spores au cours du temps.

La deuxième partie consiste à traiter les données du tableau avec des codes écrits en Matlab.

On a deux exemples de tracking que on a fait sur Fiji:




tracking 1





tracking 2